Bộ môn Khoa học & Kĩ thuật Tính toán Dept

Bản thuyết trình với chủ đề: "Bộ môn Khoa học & Kĩ thuật Tính toán Dept"— Bản ghi của bản thuyết trình:

1 Bộ môn Khoa học & Kĩ thuật Tính toán Dept
Bộ môn Khoa học & Kĩ thuật Tính toán Dept. of Computational Sciences and Engineering @Phòng 319, Nhà E3 01 PGS. 06 TS. 06 Cán bộ tạo nguồn.

2 Các nhóm nghiên cứu chính
Phòng thí nghiệm Tin Sinh Y học (Bingo Lab) Học máy, trí tuệ nhân tạo ứng dụng trong xử lý, phân tích dữ liệu lớn y sinh dược học. PGS. TS. Lê Sỹ Vinh TS. Đặng Thanh Hải TS. Đặng Cao Cường TS. Hoàng Thị Điệp TS. Đỗ Đức Đông CN. Nguyễn Đức Cảnh Xử lý ngôn ngữ tự nhiên cho văn bản y sinh TS. Đặng Thanh Hải Phòng thí nghiệm Tối ưu hoá (ORLab) Vận trù học, tối ưu hoá hệ thống lớn TS. Hà Minh Hoàng TS. Đỗ Đức Đông; TS. Hoàng Thị Điệp; 01 cán bộ tạo nguồn Nhóm NC Mật mã, an toàn thông tin TS. Lê Phê Đô + 01 cán bộ tạo nguồn

3 Bingo Lab ML/AI ứng dụng phân tích dữ liệu lớn …
Phân tích dữ liệu (lớn) hệ gien (genomic data) và ứng dụng trong y tế Thành viên: PGS. TS. LS Vinh; TS. DC Cường; TS. HT Điệp; CN. NĐ Cảnh Hợp tác Viện dữ liệu lớn Vingroup, bệnh viện VinMec, Khoa Y Dược, GS. Arnde von Haeseler, Đại học Vienna, Áo TS. Bùi Quang Minh, ĐH Quốc Gia Úc. Thành viên trước đây: 02 sinh viên K58, hiện đang làm ở Google, Vương quốc Anh.

4 Bingo Lab ML/AI ứng dụng phân tích dữ liệu lớn …
Học sâu và ứng dụng trong tin sinh học Thành viên: TS. ĐT Hải; TS. ĐĐ Đông; TS. ĐC Cường Hợp tác TS. Cao Minh Đức, 4Catalyzer.com, USA. TS. Nguyễn Hoàng Anh, ĐH Queensland, Úc. TS. Võ Sỹ Nam, Viện Bigdata, Vingroup. PGS. TS. Nguyễn Cảnh Hào, Đại học Kytoto, Nhật Bản. Thành viên trước đây: 01 sinh viên K59, hiện đang học Thạc sỹ ở JAIST, Nhật Bản.

5 Bingo Lab Xử lý ngôn ngữ tự nhiên cho y văn
Học sâu & ứng dụng trong NLP for bio text Thành viên: TS. Đặng Thanh Hải 10 sinh viên thực tập Hợp tác GS. Nigel Collier, ĐH Cambridge, Vương quốc Anh. PGS. TS. Trần Thế Truyền, ĐH Deakin, Úc Thành viên trước đây: Vũ Tiến Sinh (K60, Giải nhất SV NKCH Cấp Bộ, 2 bài báo quốc tế), học bổng chính phủ Nhật (MEXT) cho chương trình Thạc sỹ (JAIST). Nguyễn Đức Minh (K60), đang làm ở Google Singapore Mạnh Thắng & Ngọc Cường (K60), đang làm ở VNG AI Research

6 ORLab Vận trù học, tối ưu hoá (fb/orlab.vn)
Thành viên: TS. HM Hoàng; TS. ĐĐ Đông; TS. HT Điệp >20 sinh viên đang thực tập Vũ Duy Mạnh, Nguyễn Thanh Lâm (K62), thực tập 6 tháng tại Đại học Bách Khoa, Montréal, Canada. Hợp tác GS. Olivier Péton, LS2N laboratory, Nantes, France GS. Louis-Martin Rousseau, Đại học Montréal, Canada. Thành viên trước đây: 02 học bổng Vingroup chương trình thạc sĩ, Đại học Limoges, Pháp. 03 học bổng toàn phần chương trình thạc sĩ, Đại học Montréal, Canada. 02 học bổng Tiến sỹ (ĐH Công nghệ Sydney, Úc và Ecole des Mines de Nantes, Pháp)

7 Nhóm NC Mật mã, an toàn thông tin
Mật mã, An ninh, an toàn thông tin Công nghệ Blockchain Trưởng nhóm: TS. Lê Phê Đô 01 Cán bộ tạo nguồn 06 sinh viên đang thực tập 01 Dự án đang triển khai (do Trường ĐH Công Nghệ tài trợ)

8 Thông tin chi tiết về các thành viên

9 HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI Tin sinh học Trí tuệ nhân tạo trong y tế
PGS. TS. Lê Sỹ Vinh Chủ nhiệm khoa CNTT Web: uet.vnu.edu.vn/~vinhls

10 TS. Lê Phê Đô HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI Mật mã ứng dụng
An toàn thông tin Blockchain TS. Lê Phê Đô Phòng 319, nhà E3 Web: uet.vnu.edu.vn/~dolp

11 TS. Đặng Thanh Hải HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI
Học máy/Học sâu (Deep learning) và ứng dụng Khai phá dữ liệu và ứng dụng Xử lý ngôn ngữ tự nhiên và ứng dụng cho văn bản y-sinh Tin sinh-y học TS. Đặng Thanh Hải Phó chủ nhiệm Bộ môn Phòng 319, nhà E3 Web: uet.vnu.edu.vn/~hai.dang

12 ThS. Hoàng Thị Điệp HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI Tin sinh học
Phân tích hệ gen và ứng dụng. Các kỹ thuật tính toán nhằm xử lý, phân tích và mô hình cây phát sinh loài, sự tiến hoá và đa dạng sinh học. Tối ưu hóa Nghiên cứu và phát triển các ứng dụng trên nền web, các thiết bị thông minh. Triển khai ứng dụng các hệ thống hỗ trợ quản lý doanh nghiệp ThS. Hoàng Thị Điệp Phòng 319, nhà E3 Web: uet.vnu.edu.vn/~diepht

13 TS. Đặng Cao Cường HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI Học máy thống kê
Trí tuệ nhân tạo. Tin Sinh học TS. Đặng Cao Cường Phòng 319, nhà E3 Web: uet.vnu.edu.vn/~cuongdc

14 TS. Đỗ Đức Đông HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI Tin sinh-y học và ứng dụng.
Tối ưu hoá và ứng dụng. Các thuật toán tối ưu meta-heuristics và ứng dụng Thiết kế và tối ưu thuật toán. Nghiên cứu và phát triển các ứng dụng trên nền web, điện thoại thông minh. Triển khai ứng dụng các hệ thống hỗ trợ quản lý doanh nghiệp TS. Đỗ Đức Đông Phòng 319, nhà E3 Web: uet.vnu.edu.vn/~dongdd

15 TS. Hà Minh Hoàng HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI Vận trù học, Tối ưu hoá
Các ứng dụng của vận trù học trong các lĩnh vực sản xuất, giao thông vận tải, tài chính, ngân hang, quảng cáo, v.v. TS. Hà Minh Hoàng Phòng 319, nhà E3 Web: uet.vnu.edu.vn/~hoanghm

16 Một số dự án đã và đang triển khai
: Nghiên cứu và phát triển các mô hình học máy tiên tiến phát hiện và trích xuất mối quan hệ tác dụng phụ của thuốc từ văn bản y sinh. Quỹ Nafosted, Bộ Khoa học và Công Nghệ. : Nghiên cứu phát triển các thuật toán giải quyết bài toán hoạch định tuyến xe và các biến thể của nó. Quỹ Nafosted, Bộ Khoa học và Công Nghệ. 2015 – 2017: Developing optimization methods for solving problems related to protein sequences, Đề tài cấp ĐHQGHN. 2014 – 2016: Fast methods for sequence analyis problems with large data sets, Quỹ Nafosted, Bộ Khoa học và Công Nghệ, 2013 – 2015: Whole genome analysis for a Vietnamese individual, Đề tài trọng điểm, Quỹ phát triển Khoa học và Công nghệ, ĐHQGHN.

17 Một số bài báo tiêu biểu gần đây nhất
2017 Quang Minh Ha and Yves Deville and Quang Dung Pham and Minh Hoang Ha (2017) On the min-cost traveling salesman problem with drone. Transportation Research Part C . (In Press) Thi Diep Hoang and Olga Chernomor and Arndt von Haeseler and Bui Quang Minh and Sy Vinh Le (2017) UFBoot2: Improving the Ultrafast Bootstrap Approximation. Molecular Biology and Evolution . msx281. ISSN Hoang Quynh Le and Duy Cat Can and Thanh Hai Dang and Mai Vu Tran and Quang Thuy Ha and Nigel Collier (2017) Improving Chemical-induced Disease Relation Extraction with Learned Features Based on Convolutional Neural Network. In: The 9th International Conference on Knowledge and Systems Engineering (KSE), October 2017, Hue, Vietnam. Phe Do Le and Manh Trung Mai and Trung Truc Le and Thi Hang Nguyen and Thi Hanh Vuong and Khac Hung Nguyen and Thi Thuy Dinh and Thi Len Le (2017) Nghiên cứu một số hệ mật mã nhẹ và ứng dụng trong IoT. Tạp chí Nghiên cứu Khoa học & Công nghệ Quân sự . ISSN Sy Vinh Le and Cuong Dang and Quang Le (2017) Improved mitochondrial amino acid substitution models for metazoan evolutionary studies. BMC Mol Evol, 17 (136). Stefan Naulaerts and Cao Cuong Dang and Pedro Ballester (2017) Precision and recall oncology: combining multiple gene mutations for improved identification of drug-sensitive tumours. Oncotarget . ISSN Anh Vu Thi Ngoc and Phuc Thai Dinh and Hoang Duc Nguyen and Thanh Hai Dang and Dong Do Duc (2017) Ant colony optimization based founder sequence reconstruction. VNU Journal of Computer Science and Communication Engineering . ISSN (In Press) 2016 Diep Thi Hoang, Vinh Le, Tomas Flouri, Alexandros Stamatakis, Arndt von Haeseler and Bui Quang Minh (2016). A new phylogenetic tree sampling method for maximum parsimony bootstrapping and proof-of-concept implementation. The Eighth International Conference on Knowledge and Systems Engineering (KSE 2016). Ha Noi, Vietnam, October 6- 8, 2016. Le H-Q, Tran M-V, Dang TH, Ha Q-T, Collier N. Sieve-based coreference resolution enhances semi-supervised learning model for chemical-induced disease relation extraction. Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2016;2016:baw131. doi: /database/baw131. Peon, Antonio, Cuong C. Dang, and Pedro J. Ballester. "How reliable are ligand-centric methods for Target Fishing?." Frontiers in chemistry 4 (2016): 15. Nguyen TT, Sy Le V, Ho HB, Si Le Q. Building ancestral recombination graphs for whole genomes. IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform Mar 16. DOI: /TCBB Đỗ Xuân Quyền, Nguyễn Hoàng Đức, Thái Đình Phúc, Đỗ Đức Đông. Phương pháp tối ưu đàn kiến dóng hàng toàn cục các mạng tước tác Protein. Kỷ yếu hội nghị FAIR 2016 (Chuẩn bị xuất bản).